5 automatiseeritud karyotüüpi tarkvara kromosoomide kaardistamiseks

Kariotüüpimine on kõikide organismis leiduvate kromosoomide tellimise ja sidumise protsess, et saada kogu inimese kromosoomide kaardist kõikehõlmav vaade.

Kuid veenduge, et me mõistame, millised kromosoomid on esimeses kohas. Kromosoomid on struktuurid, mis sarnanevad niisuguste niitidega, mis paiknevad iga keha raku tuumas.

Iga kromosoomistruktuur sisaldab kogu keha geneetilise informatsiooni plaani. See dikteerib, kuidas keha on struktureeritud, reageerib stiimulitele, eelsoodumus haigustele jne. Naistel on 2 "X" kromosoomi ja meestel on üks "X" ja "Y" kromosoom. Iga teie keharakk sisaldab 23 paari kromosoomi, kokku 46 kromosoomi.

Selleks, et teadlased saaksid iga patsiendi kromosoomide järjestusi mõista, kasutavad nad karyotüüpi tarkvara . Seda tüüpi tarkvara on loodud kromosoomianalüüsi tegemiseks ning hindab inimese kromosoomide struktuuri ja arvu. Seda tehes võivad teadlased ja teadlased avastada kõrvalekaldeid.

Käesolevas artiklis uurime suurepäraseid tarkvaravõimalusi, mis võimaldavad teil teha karyotüüpide analüüsi.

Top 5 automatiseeritud karyotyping tööriistu kasutada 2019

ArgusSoft

ArgusSoft on suurepärane tarkvaravõimalus, mis võimaldab teil automaatselt krüptida inimese kromosoome bändi positsiooni järgi ning seda saab kasutada ka loomade ja taimede kromosoomide kariotüüpimiseks võrgus.

Põhijooned:

G, Q, R värvimine
Inimeste kromosoomide automatiseeritud karyotüpiseerimine koos kõverate äratundmisega
Sigade kromosoomide automatiseeritud kariotüüpimine
3 inimese kromosoomide standardsete ideogrammide sisseehitatud alused, millel on erinevad selguse tasemed - 400, 550 ja 850 taset
Võib lisada standardseid kromosoomi ideogramme teistele looma- ja taimeliikidele
Proovi ettevalmistamise meetodid
Metafaasiplaatide kujutiste sisestamine kaamera ja skanneriga
Pilti lisamine graafikaga
Rakendatud ja kontakteeruvate kromosoomide automatiseeritud jagamine
Kromosoomide ja ideogrammide võrdlus

ArgusSoftit saab kasutada ka kromosoomide tuvastamise süsteemi treenimiseks eelnevalt kindlaksmääratud preparaatide abil, edastada metafaasiplaatide pilte ja karyogramme sisseehitatud andmebaasis, luua aruannete mustreid, korrigeerida karyogramme ning salvestada ja printida pilte ja analüüsitulemusi.

ArgusSofti kasutamise kohta saate koolitust ja tuge oma ametlikul veebilehel. Tugikeskus sisaldab koolitust, hooldust ja nõustamisteenuseid.

Proovige ArgusSoftit

HiBand rakendatud spektraalkujutise abil

HiBand on Applied Spectral Imaging'i loodud tarkvara, mis suudab täiendada kromosoomianalüüsi, kasutades digitaalset kariotüübi funktsiooni. See tarkvara

kasutab kromosoomistruktuuri põhjalikuks analüüsiks automatiseeritud skaneerimisfunktsioone.

Saate kasutada HiBandis leiduvaid mitmesuguseid funktsioone tulemuste andmete indekseerimiseks, lugemiseks, salvestamiseks ja haldamiseks. Võite kasutada seda võimsat tarkvara kromosoomijärjestuse automaatseks skaneerimiseks.

Leitud karyotyping funktsioonide abil saadud tulemused HiBand saab salvestada turvalises kohas, kus on parooliga kaitstud ja krüpteeritud kihid. See võimaldab teil rahulikult kinni pidada oluliste sekveneerimisandmete kaotamisest ning seetõttu parandab ka teie laboritõhusust.

Tulemuste sorteerimine toimub väga lihtsal viisil, peate lihtsalt otsima konkreetse kromosoomide jada ning kõik tulemused kuvatakse hästi varjatud ekraanil, mis pakub lihtsat juurdepääsu muutmiseks, ülevaatamiseks ja ka silte lisamiseks mis tahes failidest.

Põhijooned:

Brightfieldi Karyotyping-G-Band ja R-Band
Fluorestsents-Karyotyping-Q-Band, R-Band ja FISH
Spektraalne kariotüüpimine
Automaatne kromosoomide loendamine
Kromosoomide indekseerimine ja liigitamine
Kromosoomide täiustatud eraldamine ja täiustatud pildi parandamine
Pildigalerii - võib ühel ekraanil esitada kõik metafaasid ja kariotüüpe
Võib võrrelda kromosoome - vaata neid kõrvuti
Abberant Ideogram - saate lisada pildigeneraatorisse kromosoome, rakke, ideogramme ja annotatsioone

HiBand kasutab laboratooriumi suurendamiseks täielikult automatiseeritud töövooge, skaneerimisfunktsioonid on „start-and-walk-away“, leiavad metafaase, automaatselt lugenud triipkoode, üleslaadivad pilte reaalajas slaidiskaneerimise ajal ning eksportivad ka laboratooriumisse LIS Central Portal ja Andmebaas.

Proovige HiBandit

MetaSystems Ikaros

Sellel kariotüübi süsteemil on väga intuitiivne kasutajaliides, mis pakub kõiki funktsioone ühel ekraanil. See võimaldab lihtsat ja kiiret juurdepääsu kogu saadud teabele.

Ikarot saab kasutada koos Neoniga, mis on platvorm, mis on loodud pildiandmete ja juhtumikorralduse abistamiseks. Neon kogub andmeid kõigist pilditöötlustöödest, välistest allikatest ja võimaldab teil neid hõlpsasti arusaadavalt esitleda juhtumite haldamise juhtpaneeli abil.

See tööriist võimaldab teil alati olulist teavet käepärast hoida ja turvaliselt talletada, kuid kasutab väga tugevaid andmehalduse algoritme, omab kena valikut andmeid andmete vaatamiseks ja võib pakkuda märksõnade ja andmeomaduste põhjal konkreetseid otsinguid.

Lisateavet Neoni ja selle funktsioonide kohta leiate siit .

Ikaros toetab paljusid erinevaid triipimismeetodeid - Brightfield G-Band ja R-Band, Fluorescence Q-Band, R-Band ja FISH - pakub suurt hulka eelnevalt defineeritud kariogrammi vorme inimestele, taimedele ja loomadele. Neid vorme saab hõlpsasti redigeerida, et lisada mis tahes uuringu tüübi jaoks vajalikke andmeid.

Asjaolu, et kromosoome saab võrrelda klasside või karyogrammidega, pakub teile väga kasulikku teavet, mis võimaldab teil kergesti tuvastada erinevusi.

Proovige Ikarot

MetaClass poolt Microptic

MetaClass on suur karyotyoping tarkvara, mis on kujundatud modulaarselt. See tarkvara aitab teil teha karyotüüpe ja kromosoomide FISH-uuringuid.

MetaClass on moodustatud järgmistest moodulitest:

MetaClass andmebaas

Andmebaas, mida saab paigaldada MetaClassi mis tahes mooduliga. Võimaldab salvestada patsiendi üksikasju ja annab teile tulemustele kergesti ligipääsu. Selle mooduliga saate luua kohandatud aruandeid mis tahes keeles.

MetaClass Karyotyping

Võimaldab teil uurida kariotüüpi pärast metafaasi ettevalmistusetapi piltide digitaliseerimist ja nende paigutamist paari suuruse, asukoha jne alusel. See moodul annab teile suurepärased kvaliteeditulemused kromosoomiribade puhul ja see võib olla ka pakkuda Teile professionaalset vaatamist.

Peamised omadused on järgmised:

Kariotüübi uuringut analüüsitakse 100-kordse heledavälja suurendusega
Võib jäädvustada mitu metafaasi kujutist
Kujutise kvaliteet on modifitseeritav teravate tulemuste jaoks
Kromosoomide automaatne klassifitseerimine
4 ekraani vaadet - metafaasi, kariotüübi ja klassifitseerimata kromosoomide aken
Saab kuvada kromosoomiprototüüpe
Kromosoome, mida ei klassifitseerita, saab automaatselt või käsitsi korrigeerida - superpositsioone, eraldamist, ristumisi, pöörlemist jne.
MTC seansifaile või BMP pilte saab igal ajal salvestada ja uuesti laadida
Võib eksportida üksikuid kromosoome Metaclass andmebaasi koos võimalusega lisada kommentaare ja märkusi

Siin on näide metaklaasi kariotüübi aruandest.

MetaClass FISH

See on analüüsimoodul, mis võimaldab teil saada fluorestseeruva IN SITU hübridisatsiooni (FISH) pilti. See moodul salvestab pildid fluorestsents-DNA-sondide abil ja võimaldab teil kinnitada geneetilisi kõrvalekaldeid - trisoomiad, mocrodelections, kromosoomide ümberkorraldused jne.

FISH-kujutisi analüüsitakse 100-kordse suurenduse all ja laiema pildi selguse huvides saab ka pildistada erinevate filtritega.

Kui olete huvitatud ülaltoodud moodulite kohta lisateabe ja muude funktsioonide kohta, saate vaadata MetaClass'i kataloogi.

Kui olete uudishimulik tüüp ja soovite näha FISH-meetodi abil saadud aruannet, saate seda teha

PDF-faili näidis.

Proovige MetaClass'i

GenASis Bandview

GenASis Bandview on veel üks suur karyotüüpi tarkvara, mis on välja ehitatud moodulitest, millel on erinevad capabitilites. Seda rakendust saab kasutada kariotüübi diagnostika teostamiseks ja täpsete testitulemuste saamiseks.

See tarkvara võimaldab teil töövoogu ja diagnoosiprotsessi täielikult kohandada, sõltuvalt teie ettevõtte vajadustest ja eesmärkidest, mida soovid saavutada.

BandView'i pakutavad laialdased tööriistad on lihtsalt ühe hiireklõpsuga kergesti ligipääsetavad ning pakub võimsaid G / R / C / Q-Band kariotüüpimise kogemusi. Metafaaside leidmiseks ja piltide püüdmiseks saate valida automaatse või manuaalse töövoo vahel.

Kromosoomi kõrvalekaldeid, kui neid leitakse, võib jälgida patsiendi geneetilise materjali lisamise, deletsiooni või ümberkorraldamise kaudu. BandView abil saate kasutada FISH-i molekulaarse tehnika ribasid.

FISH kasutab kromosoomi erinevatele osadele kinnitamiseks fluorestseeruvaid sonde, võimaldades tarkvaral tuvastada ja lokaliseerida spetsiifilistes DNA järjestustes leitud abnormaliteidid.

Proovige GenASis Bandview'i

Järeldus

Käesolevas artiklis uurisime mõningaid parimaid automatiseeritud karyotüüpimise tarkvara, mis on turul 2018. aasta lõpus.

Käesolevas artiklis käsitletud karyotüüpi tarkvara valikud pakuvad teile erinevaid funktsioone, mis aitavad teil oma ettevõtte eesmärke saavutada.

Seda tüüpi tarkvara kasutades saate kiiresti arvutada tuhandeid kromosoomistruktuure, analüüsida erinevate professionaalsete tehnikatega ja koostada kõrge kvaliteediga aruandeid, mis võimaldavad teil kergesti tuvastada mis tahes kõrvalekaldeid.

Sooviksime teada, milline on teie arvamus tarkvara kohta, mille me selles top 5 nimekirjas esitlesime. Palun andke meile teada, kasutades allpool toodud kommentaaride osa.

SEOTUD JUHISED, MIDA TE VAJA TEAVITADA: